Temeljna razlika je v prodoru mikrovalov. Zaradi uporabe elektromagnetnih valov z valovno dolžino 122 mm (valovna dolžina daljnoinfrardečega je manjša od 1 mm), je njegova penetrirajoča sposobnost več kot 100-krat manjša od daljnoinfrardečega elektromagnetnega valovanja, zato lahko hitro odpre kapilare in popolnoma izboljša krvni obtok lezije.
Glavni mehanizmi zdravljenja so naslednji:
1. Molekule vode in nabojne snovi v tkivu lezije absorbirajo prodreto mikrovalovno energijo in se nato nihajo in vrtijo. Temperatura tkiv je povečana, kapilare, ki so bile prvotno blokirane, se odprejo, krvni pretok pa se podvoji.
2. Veliko število belih krvnih celic, makrofag in imunskih beljakovin krožijo okoli celic lezije, da bi dosegli učinek odstranjevanja vnetnih snovi in absorbira vnetje za odpravo otekline.
3. Ker je velika količina sveže krvi parfusiran v tkivo lezije, lahko celice lezije tkivo zlahka pridobijo hranila, ki so potrebna za življenje in presnovo, tako da se lahko bolezenske celice same in njihove funkcije obnovijo.
4. Encimi lahko normalno delujejo le pri temperaturi okoli 37 °C. Ko se človeška tkiva vrnejo na normalno telesno temperaturo z izboljšanjem krvnega obtoka, lahko encimi igrajo svojo ustrezno vlogo.
5. Po lokalnih tkivih človeškega telesa absorbira mikrovalovno energijo, temperatura narašča, in intersticij, ki obdaja krvne žile povzroča aksonove reflekse, razteguje krvne žile, zelo poveča pretok krvi, učinkovito odpravlja snovi, ki povzročajo bolečino, ki jih povzroča presnova, in popravlja kislinsko bazno ravnovesje. Hkrati aktivacija »temperaturnega sensationa« zavira živčno prevodnost »bolečinske sensacije«, zato ima dvojni učinek hitrega lajšanja in lajšanja bolečine.